MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 48350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013385	T	6	6	41	46	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013385	G	7	7	175	181	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013385	TGG	2	6	189	194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891931
4	NC_013385	CAAG	2	8	379	386	50 %	0 %	25 %	25 %	260891931
5	NC_013385	GTG	2	6	533	538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891931
6	NC_013385	GCG	2	6	563	568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891931
7	NC_013385	TGGCCG	2	12	573	584	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260891931
8	NC_013385	G	7	7	623	629	0 %	0 %	100 %	0 %	260891931
9	NC_013385	CCA	2	6	667	672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891931
10	NC_013385	GCC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891931
11	NC_013385	ACC	2	6	713	718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891931
12	NC_013385	GAT	2	6	736	741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891931
13	NC_013385	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891931
14	NC_013385	AAG	2	6	849	854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891931
15	NC_013385	GCG	2	6	887	892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891931
16	NC_013385	CCGC	2	8	916	923	0 %	0 %	25 %	75 %	260891931
17	NC_013385	TACC	2	8	933	940	25 %	25 %	0 %	50 %	260891931
18	NC_013385	AGA	2	6	943	948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891931
19	NC_013385	A	6	6	1031	1036	100 %	0 %	0 %	0 %	260891931
20	NC_013385	GTG	2	6	1136	1141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891931
21	NC_013385	CGC	2	6	1147	1152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891931
22	NC_013385	GCC	2	6	1184	1189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891931
23	NC_013385	AAGA	2	8	1223	1230	75 %	0 %	25 %	0 %	260891931
24	NC_013385	GTG	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891931
25	NC_013385	AAG	2	6	1301	1306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891931
26	NC_013385	TC	3	6	1369	1374	0 %	50 %	0 %	50 %	260891931
27	NC_013385	CGG	2	6	1399	1404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891931
28	NC_013385	TAC	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891931
29	NC_013385	TGC	2	6	1422	1427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891931
30	NC_013385	GCT	2	6	1448	1453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891931
31	NC_013385	A	6	6	1507	1512	100 %	0 %	0 %	0 %	260891931
32	NC_013385	CAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013385	ACT	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013385	TGA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013385	CTGC	2	8	1710	1717	0 %	25 %	25 %	50 %	260891932
36	NC_013385	GGAA	3	12	1769	1780	50 %	0 %	50 %	0 %	260891932
37	NC_013385	AGG	2	6	1850	1855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891932
38	NC_013385	GCC	2	6	1901	1906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891932
39	NC_013385	CAGG	2	8	1932	1939	25 %	0 %	50 %	25 %	260891932
40	NC_013385	CGG	2	6	1971	1976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891932
41	NC_013385	GGA	2	6	2034	2039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891932
42	NC_013385	CCG	2	6	2208	2213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891932
43	NC_013385	GAG	2	6	2218	2223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891932
44	NC_013385	AGG	2	6	2264	2269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891932
45	NC_013385	CTTC	2	8	2333	2340	0 %	50 %	0 %	50 %	260891932
46	NC_013385	GAG	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891932
47	NC_013385	GCA	2	6	2397	2402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891932
48	NC_013385	TCC	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891932
49	NC_013385	CGG	2	6	2513	2518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891932
50	NC_013385	ACT	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891933
51	NC_013385	CTG	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891933
52	NC_013385	TTTTG	2	10	2931	2940	0 %	80 %	20 %	0 %	260891933
53	NC_013385	GAA	2	6	2968	2973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891933
54	NC_013385	ACG	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891933
55	NC_013385	TCA	2	6	3005	3010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891933
56	NC_013385	CTTCT	2	10	3076	3085	0 %	60 %	0 %	40 %	260891933
57	NC_013385	CGC	2	6	3106	3111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891933
58	NC_013385	GGT	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891933
59	NC_013385	TGG	2	6	3161	3166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891933
60	NC_013385	CGG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891933
61	NC_013385	AGAGG	2	10	3185	3194	40 %	0 %	60 %	0 %	260891933
62	NC_013385	TTC	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891933
63	NC_013385	AGC	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891933
64	NC_013385	AGA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891933
65	NC_013385	TCC	2	6	3406	3411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891933
66	NC_013385	TGG	2	6	3425	3430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891933
67	NC_013385	AAG	2	6	3433	3438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891933
68	NC_013385	TC	3	6	3467	3472	0 %	50 %	0 %	50 %	260891933
69	NC_013385	GAGAAG	2	12	3529	3540	50 %	0 %	50 %	0 %	260891933
70	NC_013385	TGG	2	6	3557	3562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891933
71	NC_013385	CGA	2	6	3573	3578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891933
72	NC_013385	GGAG	2	8	3594	3601	25 %	0 %	75 %	0 %	260891933
73	NC_013385	CG	3	6	3623	3628	0 %	0 %	50 %	50 %	260891933
74	NC_013385	AGA	2	6	3683	3688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891933
75	NC_013385	GA	3	6	3695	3700	50 %	0 %	50 %	0 %	260891933
76	NC_013385	TCT	3	9	3707	3715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891933
77	NC_013385	GAC	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891933
78	NC_013385	GCC	2	6	3749	3754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891933
79	NC_013385	GAA	2	6	3775	3780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891933
80	NC_013385	GCC	2	6	3862	3867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891933
81	NC_013385	AAG	2	6	3934	3939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891934
82	NC_013385	GGCG	2	8	4035	4042	0 %	0 %	75 %	25 %	260891934
83	NC_013385	CGG	2	6	4117	4122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891934
84	NC_013385	GGA	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891934
85	NC_013385	AG	3	6	4148	4153	50 %	0 %	50 %	0 %	260891934
86	NC_013385	AAG	2	6	4175	4180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891935
87	NC_013385	GAA	2	6	4192	4197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891935
88	NC_013385	GCC	2	6	4247	4252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891935
89	NC_013385	CAC	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891935
90	NC_013385	GGT	2	6	4308	4313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
91	NC_013385	ACA	2	6	4316	4321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260891935
92	NC_013385	GGT	2	6	4362	4367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
93	NC_013385	CAAG	2	8	4371	4378	50 %	0 %	25 %	25 %	260891935
94	NC_013385	CGGG	2	8	4404	4411	0 %	0 %	75 %	25 %	260891935
95	NC_013385	ACC	2	6	4468	4473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891935
96	NC_013385	GGA	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891935
97	NC_013385	GGC	2	6	4495	4500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891935
98	NC_013385	G	6	6	4501	4506	0 %	0 %	100 %	0 %	260891935
99	NC_013385	TGG	2	6	4518	4523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
100	NC_013385	GGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
101	NC_013385	GGC	2	6	4604	4609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891935
102	NC_013385	GA	3	6	4655	4660	50 %	0 %	50 %	0 %	260891935
103	NC_013385	ACC	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891935
104	NC_013385	TCCT	2	8	4762	4769	0 %	50 %	0 %	50 %	260891935
105	NC_013385	CCA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891935
106	NC_013385	AGGG	2	8	4835	4842	25 %	0 %	75 %	0 %	260891935
107	NC_013385	TCC	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891935
108	NC_013385	TGG	3	9	4928	4936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
109	NC_013385	GCC	2	6	4939	4944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891935
110	NC_013385	AGGC	2	8	5024	5031	25 %	0 %	50 %	25 %	260891935
111	NC_013385	GGT	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
112	NC_013385	GGA	2	6	5112	5117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891935
113	NC_013385	CCG	2	6	5135	5140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260891935
114	NC_013385	TGG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891935
115	NC_013385	AGACCA	2	12	5180	5191	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	260891935
116	NC_013385	TAG	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891935
117	NC_013385	GAG	2	6	5260	5265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891935
118	NC_013385	GGC	3	9	5304	5312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891935
119	NC_013385	GGC	2	6	5325	5330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891935
120	NC_013385	CGG	2	6	5456	5461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891935
121	NC_013385	TTA	2	6	5585	5590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260891935
122	NC_013385	AAG	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891935
123	NC_013385	TCA	3	9	5651	5659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260891935
124	NC_013385	CTT	3	9	5709	5717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891935
125	NC_013385	AGCCC	2	10	5760	5769	20 %	0 %	20 %	60 %	260891935
126	NC_013385	CT	3	6	5771	5776	0 %	50 %	0 %	50 %	260891935
127	NC_013385	GAAAG	2	10	5792	5801	60 %	0 %	40 %	0 %	260891935
128	NC_013385	ACG	2	6	5816	5821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891935
129	NC_013385	ACC	2	6	5920	5925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891935
130	NC_013385	TCC	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891935
131	NC_013385	GGA	2	6	5964	5969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891935
132	NC_013385	TGA	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260891935
133	NC_013385	CCGCA	2	10	6272	6281	20 %	0 %	20 %	60 %	260891936
134	NC_013385	TCG	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891936
135	NC_013385	ACC	2	6	6318	6323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891936
136	NC_013385	ACG	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891936
137	NC_013385	TGG	2	6	6393	6398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891936
138	NC_013385	TGC	2	6	6489	6494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891936
139	NC_013385	ACG	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260891936
140	NC_013385	CAC	2	6	6541	6546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891936
141	NC_013385	CTG	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891936
142	NC_013385	TTC	2	6	6561	6566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260891936
143	NC_013385	CCT	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891936
144	NC_013385	CGG	2	6	6600	6605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891936
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146	NC_013385	C	6	6	6634	6639	0 %	0 %	0 %	100 %	260891936
147	NC_013385	CTG	2	6	6668	6673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891936
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150	NC_013385	GCG	2	6	6798	6803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891936
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157	NC_013385	ACC	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891936
158	NC_013385	GGT	2	6	7162	7167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891936
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168	NC_013385	AGG	2	6	7488	7493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891936
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170	NC_013385	CGG	2	6	7584	7589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891936
171	NC_013385	GGT	3	9	7594	7602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891936
172	NC_013385	CTC	2	6	7604	7609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260891936
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174	NC_013385	CAGC	2	8	7654	7661	25 %	0 %	25 %	50 %	260891936
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232	NC_013385	T	6	6	10093	10098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_013385	A	6	6	10131	10136	100 %	0 %	0 %	0 %	260891939
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250	NC_013385	TAT	2	6	10782	10787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260891939
251	NC_013385	ACA	2	6	10825	10830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260891939
252	NC_013385	GGC	2	6	10949	10954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891939
253	NC_013385	GGT	2	6	11006	11011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260891939
254	NC_013385	TGC	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260891939
255	NC_013385	G	7	7	11093	11099	0 %	0 %	100 %	0 %	260891939
256	NC_013385	GTTTAA	2	12	11210	11221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	260891939
257	NC_013385	GGCCCA	2	12	11237	11248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	260891939
258	NC_013385	GGA	2	6	11261	11266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891939
259	NC_013385	GAG	2	6	11271	11276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260891939
260	NC_013385	GAA	2	6	11382	11387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260891940
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262	NC_013385	CCA	2	6	11434	11439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260891940
263	NC_013385	CGG	3	9	11446	11454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891940
264	NC_013385	GGC	2	6	11470	11475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891940
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266	NC_013385	CGG	2	6	11564	11569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891940
267	NC_013385	GGC	2	6	11579	11584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260891940
268	NC_013385	AAT	2	6	11714	11719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260891940
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391	NC_013385	TCCC	2	8	17531	17538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
392	NC_013385	CCG	2	6	17569	17574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
393	NC_013385	CGG	2	6	17604	17609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_013385	GA	3	6	17885	17890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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